Descobrí uma ferramenta interessante para cópia de arquivos em rede, então lá vai a dica:

Trata-se do DeltaCopy, um software sob a licença GPL que utiliza o protocolo rsync para a transferência de arquivos à partir de máquinas Windows. Funciona no estilo cliente/servidor e em alguns testes que eu já fiz, se mostrou bastante rápido.

A transferência é feita de forma totalmente transparente, e com a possibilidade de fazer o agendamento das tranferências. Permite fazer backups incrementais, enviar e-mails com log da tarfa realizada, e também está disponível o tunelamento via ssh se o servidor de destino for um sistema linux rodando rsync.

O link para download e maiores informações, vocês podem encontrar em http://www.aboutmyip.com/AboutMyXApp/DeltaCopy.jsp e http://www.ghacks.net/2008/10/02/windows-backup-software-deltacopy/